Laboratório de QSAR e Modelagem Molecular de Compostos Bioativos
 Instituto de Química - Universidade de São Paulo

Profª. Assoc. Antonia Tavares do Amaral

Bem vindo à página do grupo do "Laboratório de QSAR e Modelagem Molecular de Compostos Bioativos" do Instituto de Química da Universidade de São Paulo, liderado pela Professora Associada Antonia Tavares do Amaral.Estrutura 3D do complexo cruzaína-inibidor (hydroxymethyl ketone inhibitor), obtida no PDB (1ME3), por cristalografia de raios-X.

Em nosso grupo de pesquisa, realizamos estudos das Relações Quantitativas entre Estrutura Química e Atividade Biológica (QSAR), usando estratégias metodológicas complementares, incluindo modelagem molecular (QSAR-3D) aplicadas ao planejamento e à compreensão do mecanismo de ação de compostos bioativos.
 

OBJETIVOS
Procura-se contribuir para elucidar o(s) mecanismo(s) de ação e fazer previsões quanto às atividades biológicas de compostos ainda não sintetizados, bem como propor novos alvos e estruturas, levando a compostos mais potentes e menos tóxicos.
 

LINHAS DE PESQUISA:

  • antibacterianos
  • antichagásicos
  • tuberculostáticos
  • anestésicos locais
  • antirretrovirais
  • compostos envolvidos em processos redox (Redoxoma)
  • compostos derivados de sais de amônio


ASPECTOS ADICIONAIS
Especial ênfase é dada ao estudo dos parâmetros físico-químicos e/ou estruturais (lipofílicos, eletrônicos, polares, estéricos, e aqueles relacionados à polarizabilidade) de compostos com atividade biológica, visando elucidar tanto a natureza de cada parâmetro estrutural responsável pela atividade, bem como o(s) mecanismo(s) das interações expressas por cada um dos parâmetros.

Técnicas quimiométricas estão sendo utilizadas e diversos procedimentos virtuais baseados nas estruturas do ligante (LIGAND BASED) e da proteína (STRUCTURE BASED) vêm sendo aplicados com sucesso no planejamento de compostos bioativos. Alguns dos compostos planejados como antichagásicos, antifúngicos e antibacterianos estão em fase de transferência para meio produtivo (patente).

Os compostos são sintetizados, adquiridos e/ou as informações retiradas da literatura. É importante ressaltar que no grupo todos os procedimentos virtuais, realizados por cálculo e envolvendo modelagem molecular, são acompanhados de sua validação experimental (testes in vitro, realizados aqui ou em colaboração com outros grupos).

Fig. 1. Fatores entálpicos e entrópicos da formação do complexo composto-receptor (ANDREWS et al., 1984).
 

PROJETOS EM ANDAMENTO
Participamos atualmente de projetos de pesquisa em redes temáticas:

  • Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia (INCT) de processos redox em biomedicina (Redoxoma) (CNPq/FAPESP)
  • Antichagásicos potenciais derivados de compostos nitro-heterocíclicos. Sub-projeto 2: Abordagens metodológicas modernas empregadas no planejamento de compostos bioativos, em especial antichagásicos potenciais: QSAR/QSAR-3D (Projeto Temático FAPESP 01/01192-3).
  • Redes Temáticas da USP: "Planejamento e Desenvolvimento de Novos Fármacos para Doenças Negligenciadas".


AGÊNCIAS FINANCIADORAS
Nossos projetos são desenvolvidos com suporte financeiro das agências:


 

Referências Bibliográficas

ANDREWS, P. R.; CRAIK, D. J.; MARTIN, J. L. Functional group contributions to drug-receptor interactions. Journal of Medicinal Chemistry, v.27, p.1648-1657, 1984.

Última atualização em 03/12/2009